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영남제분 회장이 SBS '그것이 알고 싶다' 측에 취재 중단을 요청한 사실이 알려지며 국민들의 원성을 사고 있다.
그러나 지난 5월 방송 직후 윤씨의 주치의가 있는 세브란스병원에서는 병원장의 공식사과와 함께 진상조사를 위한 교원윤리위원회를 열었다. 또 검찰은 병원을 압수수색하는 등 수사에 들어갔다. 제작진은 영남제분 회장의 해명을 전제로 여러 공모자들을 직접 찾아가 그의 논리를 뒷받침 해줄 근거를 찾았다. 그러나 생각지 못한 숨은 공모자들과 검은 뒷돈이 숨어있는 진실을 발견, 시청자들을 분노케 했다.
또 제작진은 형집행정지에 대해 변호사와 검사측은 긴밀한 친분관계가 있는 사실을 밝히며, 우연이라고 하기에 의심스러운 부분이 많은 이 관계에 대해 해명을 요구했지만 모두 방송과의 인터뷰를 거절하는 모습을 보였다. 이에 제작진은 형집행정지에 관해 주치의 뿐 아니라 관계자 모두를 원점에서 철저히 수사할 것을 재차 강조했다.